A pesar de como se ve desde fuera la saga Ninja Gaiden, ya el diseño de niveles era un pilar fundamental en sus orígenes 2D, prácticamente una de las bases de los juegos protagonizados por Hayabusa.
Itagaki entendió esto a la perfección cuando tomo el mando de la franquicia y por ello convirtió a Ninja Gaiden Black de Xbox en prácticamente un Metroidvaina, donde las localizaciones, los secretos, el backtracking y los mapas estaban a la orden del día. Llegar desde la aldea Hayabusa hasta el imperio Vigoor no era una cuestión de un cambio estético del fondo donde te dabas de piñazos con los enemigos, era un viaje en todo el sentido de la palabra. Una capital con calles donde perderte, llaves para desbloquear atajos o zonas ocultas, el subsuelo de la capital como todo un nivel repleto de mecánicas nuevas y enemigos poderosos, etc. El mundo de Ninja Gaiden 1 se sentía vivo, cohesionado y tangible.
En Ninja Gaiden 2 la cosa se redujo bastante, pasamos de un juego más redondo con aspiraciones de aventura completa, a un Hack & Slash más al uso, un juego diseccionado por capítulos. Pero aún así seguía conservando la misma filosofía de diseño que el anterior, cada nivel tenia propósito, un sentido, aportaba algo nuevo y traía consigo la introducción de ciertas mecanicas e incluso armas concretas. Para ejemplo el nivel "La Capital Acuática", con los enemigos acuáticos y la Gatlin de espolones. Ninja Gaiden 2 pasaba de un metroidvania a un Hack & Slash más directo y dinámico que te llevaba de la mano en una aventura al rededor del globo, con localizaciones que aportaban a su formula jugable.
Ninja Gaiden 4 se cae con todo el equipo en este aspecto. Sinceramente se podría decir que es el peor diseño de niveles de toda la saga, y que la falta de lo mismos deja al juego cojo, siendo cada nuevo fondo cyberpunk o boscoso ninja, cartón piedra donde esperar la siguiente ola de enemigos a los que partirles la cara. La base del juego es buena, el combate es lo mejor que tiene de hecho, pero no se, si por prisas o por mandato propio, se han follado uno de los pilares de la saga por completo, de hecho viniendo de juegos como Bayonetta 2 o Nier automata, sorprende la falta de cariño e ideas en ese aspecto.