Intolerable pues a Ezio le vemos casualmente recibir la misma cicatriz que tiene Desmond.
Yo creo que del 1 al 2 alguien se dio cuenta de lo de la cicatriz y luego buscaron una excusa, pero apuesto a que la idea original es que Desmond y Altair eran iguales, sin complicarse demasiado en el porqué, porque era más fácil de entender que el prota en el pasado era el mismo si seguía pareciendo el mismo.
Ya bastante sorpresa fue para la gente todo lo del Animus, porque todo el mundo esperaba un juego solo historico. como para complicarlo aún más con que de repente Desmond tuviese otra cara.
Luego más adelante en la saga ya todo el mundo entiende como funciona, y además los nuevos personajes del presente no tienen mucha relevancia.